|
|
Functional annotation of non-model bacteria based on sequential homology
Polakovičová, Petra ; Musilová, Jana (oponent) ; Sedlář, Karel (vedoucí práce)
The genome sequence is an essential informational resource in the field of biology and it is, therefore, a constant subject of scientific research. Bioinformatics offers computational methods for genome’s automatic analysis and processing. The bachelor thesis is dedicated to the bacterial genome, its organization, and fundamental characteristics, and subsequently description of its annotation. It mainly focuses on functional annotation (description of the biological function of predicted genes) using assignment to clusters of orthologous genes (COG) based on sequential homology. It describes the most commonly used tools and databases that use this type of annotation and then compares some of them by annotating seven bacterial genomes. Its main task is to propose a new method that improves COG annotation and makes it easy to visualize.
|
|
|
Interakce ARP2/3 s komponentami rostlinné sekretorické dráhy
Voloshina, Mariia ; Schwarzerová, Kateřina (vedoucí práce) ; Oulehlová, Denisa (oponent)
ARP2/3 je evolučně konzervovaný proteinový komplex, podílející se na nukleaci aktinu. U živočichů mutace podjednotek ARP2/3 je většinou letální. Oproti tomu arp2/3 rostliny jsou životaschopné, ale mají několik morfologických defektů. Jedním z charakteristických fenotypických projevů arp2/3 rostlin je narušená buněčná adheze. To naznačuje roli ARP2/3 komplexu v sekreci rostlinné buněčné stěny, hlavně její pektinové složky. Není však jasně, jaký je přesný molekulární mechanismus funkce ARP2/3 v této dráze. Předběžné výsledky naznačují možnou interakci ARP2/3 s proteiny sekretorické dráhy GNL1, COPI a COG. Tato práce kombinuje dvě metody - TIRFM/VAEM a koimunoprecipitaci - pro hodnocení míry kolokalizace a stanovení interakce ARP2/3 s vybranými markery. Interakce studovaných proteinů s ARP2/3 komplexem však v této práci prokázaná nebyla. Tato práce zároveň popisuje chování COPI, COG a GNL1 pomocí TIRFM/VAEM a naznačila možnou interakci GNL1 s endocytotickým markerem na plazmatické membráně. Klíčová slova: ARP2/3, COPI, COG, GNL1, sekretorická dráha
|
|
|
Stabilita kyčelního kloubu a prevence zranění ve sportu
ČERVENÝ, Daniel
Cílem této práce je popsat, jaký vliv má posílení stabilizačních svalů kyčelního kloubu na celkovou posturální stabilitu a současně jak se změní stability stoje na jedné dolní končetině u sportovců v odlišných sportech. V teoretické části jsou rozebrány a shrnuty základní informace o anatomii a kineziologii kyčelního kloubu včetně podstatných úhlů měřených při vývoji kyčelního kloubu. Dále je zde popsána posturální stabilita a funkce stability na jednotlivých úrovních lidského těla společně s popsáním svalů účastnících se této stabilizace. V praktické části je popsaný výzkum tří sportujících probandů z odvětví běžeckého lyžování, atletiky a triatlonu. Měření proběhlo formou posturografie, kineziologického rozboru a provedením několika speciálních tesů. V průběhu terapie dostali pacienti vytvořenou cvičební jednotku se stejnými cviky, ale doplněnou o individuální cvičení, zaměřené na konkrétní problem pacienta. Po ukončení testování došlo k porovnání vstupních a výstupních hodnot a vyvození závěru. Výsledný efekt terapie lze považovat za pozitivní, jelikož u probandů došlo ke zlepšení výstupních hodnot u testů hodnotící stabilitu, polohu COG i samotnou laterální stabilitu kyčelních kloubů. Dalším výsledkem bylo subjektivní hodnocení probandů formou rozhovoru, kdy pacienti hodnotili terapii pozitivně a chtěli pokračovat v další spolupráci.
|
|
|
Functional annotation of non-model bacteria based on sequential homology
Polakovičová, Petra ; Musilová, Jana (oponent) ; Sedlář, Karel (vedoucí práce)
The genome sequence is an essential informational resource in the field of biology and it is, therefore, a constant subject of scientific research. Bioinformatics offers computational methods for genome’s automatic analysis and processing. The bachelor thesis is dedicated to the bacterial genome, its organization, and fundamental characteristics, and subsequently description of its annotation. It mainly focuses on functional annotation (description of the biological function of predicted genes) using assignment to clusters of orthologous genes (COG) based on sequential homology. It describes the most commonly used tools and databases that use this type of annotation and then compares some of them by annotating seven bacterial genomes. Its main task is to propose a new method that improves COG annotation and makes it easy to visualize.
|
|
|
Hodnocení posturální stability sportovců
Vlasáková, Kristýna ; Vomáčková, Helena (vedoucí práce) ; Pavlů, Dagmar (oponent)
Název: Hodnocení posturální stability sportovců - literární rešerše Cíle: Práce se zabývá průřezovou studií analyzující výzkumné práce hodnotící dynamickou posturální stabilitu sportovců. Porovnává analýzy a výsledky výzkumů či šetření různých autorů pracujících s touto tematikou. Pojmenovává také testy a přístroje užívané v klinické praxi. Zkoumá, v jakých sportovních odvětvích byla posturální stabilita testována, jakým způsobem a s jakými výsledky. K moderním přístrojům dynamické posturografie s výpovědními a objektivními hodnotami patří EquiTest od firmy NeuroCom. Praktická část je soustředěna především na výsledky vyšetření tímto přístrojem. Metody: Diplomová práce má deskriptivně-analytický charakter. Je zpracována formou průřezové studie. Výsledky: Do rešerše bylo zavzato 142 studií, z nichž pouze 11 se týkalo hodnocení posturální stability sportovců. Mezi měřená sportovní odvětví patří tenis, fotbal, basebal, tai-chi, taekwondo, gymnastika, basket, softbal. Celá testovací baterie EquiTestu (obsahujícící 7 testů - Sensory Organization Test, Motor Coordination and Control Test, Adaptation Test, Unilateral Stance Test, Limits Of Stability Test, Rhytmics Weight Shift, Weight Bearing Squat) nebyla v rámci sledovaných studií využita, ačkoliv je to doporučeným postupem doloženým větší mírou...
|
host ::
RSS.